按照自治区《实施方案》要求，我区“小金库”专项治理重点检查阶段工作自7月初开展以来，经过全区各级专项治理机构和全区检查人员三个多月的努力工作，目前我区“小金库”重点检查外勤工作已基本结束，并已全面转入检查报告审理处理和案件查处阶段。
 
据各级“治理办”提供的材料统计，全区各级“治理办”按照“重点检查面不低于纳入治理范围单位总数5%以及重点领域、重点部门、重点单位20%”的要求，结合受理群众举报，截至2009年10月9日，共确定了3051户行政事业单位作为重点检查对象（含受理举报，下同），其中自治区本级40个部门226户，14个市2,825户。截至2009年10月9日，已完成外勤检查工作3040户，其中自治区本级220户，各市（含所属县、市、区）2,821户，正在实施检查10户（自治区本级6户，各市4户）。

通过检查，共查出各类违规违纪问题881户，涉及资金103,396.58万元，其中小金库问题206户，涉及金额16,067.51万元，违规发放津补贴发放、预算管理不严格、财务资产管理不规范等其他问题675户，涉及金额87,329.07万元。已经处理143户，涉及金额3,034.55万元，其中“小金库”问题40户，涉及金额1,313.92万元；已由财政审计部门下达处理决定128件，移送纪检机关查处13件，移送检察机关查处2件。其他案件仍处于检查报告审理和报告征求意见阶段。